Вся система НАССР будується на семи базових принципах які послідовно застосовуються до будь-якого харчового виробництва:
Принцип 1
Аналіз небезпечних факторів
Виявлення всіх біологічних, хімічних і фізичних небезпек на кожному етапі виробництва
Принцип 2
Визначення ККТ
Встановлення критичних контрольних точок де необхідний контроль для усунення небезпеки
Принцип 3
Встановлення критичних меж
Визначення допустимих меж для кожної ККТ (наприклад температура пастеризації мінімум 72°C)
Принцип 4
Моніторинг ККТ
Регулярне вимірювання і реєстрація показників у критичних контрольних точках
Принцип 5
Коригувальні дії
Чіткий план дій що робити коли показники виходять за критичні межі
Принцип 6
Верифікація системи
Перевірка ефективності впровадженої системи НАССР через аудити і лабораторні дослідження
Принцип 7
Ведення документації
Детальне документування всіх процедур, результатів моніторингу і коригувальних дій — доказова база для перевіряючих органів